А1В2ПФ1-NHЭт-C10-NH2

Описание:

А1В2ПФ1-NHЭт-C10-NH2 представляет собой ключевой строительный блок для создания деградаторов белков, в частности для технологии SNIPER (специфический негенетический ингибитор белка-эрэйзера апоптоза, зависимый от IAP). Продукт разработан НПО ЭкоТек на основе компьютерного моделирования. Конъюгат содержит: 1) лиганд для рекрутирования IAP, полученный in silico; 2) алкильный линкер C10; 3) терминальную аминогруппу для реакции с карбоновой кислотой целевого вариабельного домена. Применяется для разработки PROTAC® и SNIPER-систем деградации белков. Физические свойства: белый кристаллический порошок, растворим в ДМСО и ацетонитриле. Совместим с другими строительными блоками, содержащими аминогруппы (CRBN, VHL-таргетные), что позволяет проводить параллельный синтез библиотек деградаторов с вариациями линкера и лигандов E3-убиквитинлигаз. Оптимизация длины и состава линкера критична для формирования стабильного тернарного комплекса «мишень-E3 лигаза-деградатор».

Применение:

Строительный блок А1В2ПФ1-NHЭт-C10-NH2 применяется для разработки бифункциональных деградаторов белков в онкологии и исследованиях механизмов протеостаза. Основные направления: 1) Создание SNIPER-систем, направленных на деградацию онкобелков через IAP-зависимый путь убиквитинирования; 2) Генерация библиотек PROTAC® с вариабельными линкерами (длина C6, C10, PEG1, PEG3); 3) Изучение кинетики деградации труднотаргетируемых белков. Продукт совместим с автоматизированными платформами синтеза, что ускоряет оптимизацию деградаторов. В экспериментах показана высокая эффективность конъюгатов с C10-линкером для деградации BRD4 и ERα. Технология разработана НПО ЭкоТек с использованием виртуального скрининга миметиков AVP.