Описание:
KB05-SLF — это бифункциональное соединение, относящееся к классу PROTAC (PROteolysis TArgeting Chimera), разработанное НПО ЭкоТек для направленной деградации белков. Состоит из лиганда FKBP12 (SLF) на одном конце и электрофильного фрагмента-разведчика 913715 на другом. Фрагменты-разведчики ковалентно связываются с доступными остатками цистеина в белках, что позволяет идентифицировать новые E3 убиквитинлигазы. Этот подход открывает перспективы для создания новых терапевтических стратегий, особенно в области онкологии и нейродегенеративных заболеваний. Соединение требует аккуратного обращения из-за высокой реакционной способности фрагмента-разведчика. Химическая формула: C₅₀H₆₃BrN₄O₁₂.
Применение:
KB05-SLF применяется в исследованиях направленной деградации белков (TPD) для идентификации новых E3 убиквитинлигаз. Механизм действия основан на ковалентном связывании фрагмента-разведчика с цистеиновыми остатками мишеней, что в сочетании с лигандом FKBP12 способствует деградации целевых белков через убиквитин-протеасомный путь. Используется в протеомных скринингах для картирования реакционноспособных цистеинов в протеоме человека. При работе необходимо учитывать неспецифическое связывание фрагмента-разведчика и включать соответствующие контроли. Дополнительные инструменты: dTAG-13 (для FKBP12F36V), Биотин-SLF (для FKBP12), ингибиторы протеасом MG123 и MLN4924, аффинный зонд Cereblon Biotin-Талидомид.