Описание:
КБ05-алкин (англ. KB05yne) — это реакционноспособное к цистеину малое молекулярное соединение (фрагмент), применяемое в химопротеомных исследованиях для изучения лигандируемости как традиционно «лекарственных» белков, так и сложных мишеней, считающихся «нелекарственными». Продукт является функционализированной версией фрагмента KB02 и содержит алкиновую группу для последующего присоединения методом клик-химии. Физически представляет собой твердое вещество кремового цвета, растворимое в полярных органических растворителях (ДМСО, ацетонитрил). Основная область применения — разработка новых терапевтических агентов и изучение протеома.
Применение:
КБ05-алкин используется в качестве инструментального фрагмента для картирования сайтов связывания на цистеиновых остатках белков. Применяется в исследованиях лигандируемости мишеней, включая «сложные» белки (например, транскрипционные факторы). Совместим с технологией PROTAC для разработки деградаторов. Экспериментальные протоколы включают инкубацию с клеточными лизатами с последующим клик-конъюгированием с биотином или флуоресцентными метками и масс-спектрометрическим анализом. НПО ЭкоТек рекомендует использовать совместно с: Реакционноспособные к цистеину фрагменты: КБ02, КБ03, КБ05, сульфоксид, зонд CoLDR. Функционализированные фрагменты: КБ02-COOH, КБ02-алкин. Электрфильные деградаторы: КБ02-SLF, КБ03-SLF, КБ05-SLF, Биотин-SLF. Зонды для химопротеомики: ИА-алкин, ИА 5-TAMRA, дестиобиотин йодацетамид, биотин йодацетамид.