Описание:
БокА1В2ПФ1-NH(С6)-NH2 — это высокоспециализированный строительный блок для разработки деградеров белков. Данное соединение содержит N-терминальную бензилоксикарбонильную защитную группу (Бок), аминогексильный линкер (С6) и свободную аминогруппу для дальнейших конъюгаций. Особенностью молекулы является инновационный лиганд, миметик AVP, полученный методами компьютерного моделирования (in silico) и селективно связывающий белки-ингибиторы апоптоза (IAP). Физически представляет собой белый или светло-бежевый кристаллический порошок, растворим в полярных органических растворителях (ДМСО, ДМФА), но нерастворим в воде. Хранить следует при -20°C в сухой атмосфере. Применяется в биомедицинских исследованиях для создания таргетных деградеров белков по технологиям SNIPER и PROTAC®.
Применение:
Строительный блок БокА1В2ПФ1-NH(С6)-NH2 позволяет синтезировать молекулы для направленной деградации белков с использованием технологии SNIPER (специфичные негенетические ингибиторы апоптозных белков). Разработанный совместно с НПО ЭкоТек, этот конъюгат содержит: 1) компьютерно-оптимизированный лиганд для рекрутирования E3-лигазы IAP; 2) алифатический гексаметиленовый линкер; 3) терминальную аминогруппу для реакции с карбоксильной группой вариабельного вархеда. Даже незначительные изменения в структуре лиганда или линкера влияют на формирование тернарного комплекса (мишень-E3-лигаза-деградер), поэтому для скрининга оптимальных деградеров создаются библиотеки аналогов. Совместим с другими строительными блоками, имеющими терминальную аминогруппу (включая мишени CRBN и VHL), что ускоряет получение библиотек SNIPER/PROTAC® с вариациями линкеров и лигандов E3-лигаз. Подробнее о лигандах IAP — в Технологическом обзоре НПО ЭкоТек.