Описание:
Набор Универсальной Неметилированной ДНК CpGenome предоставляет два отдельных контроля геномной ДНК для исследований метилирования генов. Этот продукт предназначен для использования с Набором Модификации ДНК CpGenome (S7820) и может применяться в качестве неметилированного контроля ДНК для исследований метилирования. Состав набора: Флакон А содержит 5 мкг (50 мкл) геномной ДНК человека концентрацией 0,1 мкг/мкл. Флакон В содержит 5 мкг (50 мкл) геномной ДНК, выделенной из первичной клеточной линии плода человека, концентрацией 0,1 мкг/мкл. Важно: ДНК должна быть предварительно модифицирована бисульфитом с использованием набора S7820 для применения со специфичными праймерами для неметилированной формы исследуемого гена. Валидация: Метил-специфичная ПЦР (MSP) проводилась на ДНК после бисульфитной модификации. Использовались различные праймерные наборы из линейки CpG WIZ. ДНК из флакона А валидирована с праймерами нескольких наборов для амплификации CpG WIZ. ДНК из флакона В также неметилирована по нескольким промоторам, протестированным с наборами CpG WIZ, и предоставляется как альтернативный источник ДНК для промоторов, которые могут быть частично метилированы в ДНК флакона А. Метилирование цитозинов, расположенных 5′ к гуанозину, известно своим глубоким влиянием на экспрессию многих эукариотических генов. В нормальных клетках метилирование происходит преимущественно в CG-бедных областях, тогда как CG-богатые участки (CpG-островки) остаются неметилированными. Исключения составляют обширное метилирование CpG-островков, связанное с транскрипционной инактивацией регуляторных областей импринтированных генов и генов на неактивной Х-хромосоме у женщин. Аберрантное метилирование обычно неметилированных CpG-островков зафиксировано как относительно частое событие в иммортализованных и трансформированных клетках и связано с инактивацией супрессоров опухолей при раке человека. Известно, что сотни CpG-островков проявляют гиперметилирование в опухолях. Для определения статуса метилирования цитозина разработано несколько методов, включая метил-чувствительную рестрикцию (RLGS), олигонуклеотидные микроматрицы, секвенирование геномной ДНК и метил-специфичную ПЦР (MSP). Одни методы полезны для открытий, другие – для мониторинга известных метилированных цитозинов. Секвенирование геномной ДНК, хотя и трудоемкое, предлагает универсальный метод детекции. MSP – установленная технология для мониторинга аномального метилирования в выбранных последовательностях генов. Используя малые количества ДНК, процедура обеспечивает чувствительное и специфичное обнаружение 5-метилцитозина в промоторах. Она применяется для изучения функции супрессоров опухолей и раннего выявления рака. Первоначальный этап как секвенирования, так и MSP – бисульфитная модификация образца ДНК. В MSP затем следует ПЦР-амплификация со специфичными праймерами, различающими метилированную и неметилированную ДНК.
Применение:
Набор Универсальной Неметилированной ДНК CpGenome используется в качестве контроля при исследованиях метилирования ДНК и метил-специфичной ПЦР (MSP). Применяется в онкологии для изучения инактивации генов-супрессоров опухолей, в эпигенетике для анализа паттернов метилирования, в диагностике ранних стадий рака. Обеспечивает надежный неметилированный контроль для валидации результатов экспериментов по метилированию. Совместим с наборами CpG WIZ и другими системами детекции метилирования. Материалы НПО ЭкоТек подходят для фундаментальных и прикладных исследований в молекулярной биологии, онкологии и генетике.