Фосфорамидит 5′-О-(4,4′-диметокситритил)-2′-О-(трет-бутилдиметилсилил)уридин-3-¹⁵N

Описание:

Высокоочищенный фосфорамидит, меченный стабильным изотопом азота-15 в положении 3 пиримидинового кольца уридина. Соединение содержит 5′-О-(4,4′-диметокситритил) (DMT) защитную группу для селективной деблокировки при синтезе олигонуклеотидов и 2′-О-(трет-бутилдиметилсилил) (TBDMS) группу для защиты 2′-гидроксила рибозы. Концентрация изотопа ¹⁵N составляет ≥98 атомных %, химическая чистота ≥95% (по данным ВЭЖХ). Продукт поставляется в виде сухого порошка или лиофилизированного твердого вещества, хранится при -20°C в инертной атмосфере. Применяется в синтезе меченых РНК-олигонуклеотидов для исследований методом ЯМР, масс-спектрометрии и изучения структурной динамики нуклеиновых кислот.

Применение:

Ключевой реагент для твердофазного синтеза РНК с изотопной меткой ¹⁵N в уридиновых остатках. Используется при создании меченых олигорибонуклеотидов для: 1) ЯМР-спектроскопии белково-нуклеиновых комплексов; 2) исследований конформационных изменений РНК методом FRET; 3) масс-спектрометрического анализа посттранскрипционных модификаций; 4) изучения рибозимов и аптамеров. Позволяет получать олигонуклеотиды высокой изотопной чистоты, необходимые для прецизионных биофизических измерений. Совместим с автоматическими синтезаторами олигонуклеотидов при стандартных протоколах фосфорамидитной химии. Процедуры деблокировки и очистки соответствуют общепринятым методикам для TBDMS-защищённых рибонуклеозидов.