Ингибитор IRE1 III, 4μ8C

Описание:

Ингибитор IRE1 III, 4μ8C — это клеточно-проницаемое соединение класса кумаринов, обладающее структурой о-гидроксиальдегида. Он избирательно подавляет РНКазную активность IRE1 (инозит-требующего фермента 1) по ковалентному механизму, формируя основание Шиффа с лизином-907 в активном центре фермента. Ингибирование проявляет зависимость от времени и концентрации: IC50 составляет 550, 230, 180, 100 и 45 нМ при предынкубации 0, 2, 4, 8 и 16 минут соответственно (по данным FRET-анализа расщепления РНК). Эффективно блокирует индуцированный стрессом эндоплазматического ретикулума (ЭР) сайт-специфический сплайсинг мРНК, а также RIDD-зависимую деградацию мРНК (IC50 = 6.9 и 4.1 мкМ для сплайсинга Xbp1 и деградации Scara3 соответственно) в культурах эмбриональных фибробластов мыши после обработки туникамицином. В клетках опухолевой ацинарной поджелудочной железы крысы AR42J ингибирует индуцированное дексаметазоном расширение емкости ЭР (эффективная концентрация 32 мкМ) и секрецию амилазы (IC50<2 мкМ). Структурный анализ показал, что ограниченный доступ воды к Lys907 в нативной конформации IRE1 объясняет необычную стабильность основания Шиффа и лежит в основе селективности ингибирования. Хотя 4μ8C также способен ингибировать аутофосфорилирование IRE1, взаимодействуя с Lys599, внутриклеточные нуклеотиды предотвращают этот процесс в физиологических условиях. Селективность и механизм действия делают 4μ8C ценным инструментом для изучения сигнального пути UPR (развернутый белковый ответ) и разработки терапевтических стратегий при заболеваниях, связанных с дисфункцией ЭР. Применяется в исследованиях нейродегенеративных заболеваний, диабета, воспаления и рака.

Применение:

Ингибитор IRE1 III, 4μ8C применяется в фундаментальных и прикладных исследованиях для модуляции сигнального пути UPR (развернутый белковый ответ) в эндоплазматическом ретикулуме. Основные направления: изучение механизмов ER-стресса при нейродегенеративных заболеваниях (болезнь Альцгеймера, Паркинсона), диабете, воспалительных процессах и онкологии. Используется в экспериментах на клеточных культурах (включая MEF и линии раковых клеток) для ингибирования сайт-специфического сплайсинга мРНК XBP1 и RIDD-зависимой деградации транскриптов. Эффективен в моделях с индукторами ER-стресса (туникамицин, дексаметазон). Позволяет исследовать роль IRE1 в секреторных процессах (например, подавление секреции амилазы в панкреатических ацинарных клетках), апоптозе и адаптационных реакциях клетки. Благодаря высокой селективности к РНКазному домену IRE1, является перспективным фармакологическим инструментом для разработки таргетной терапии.