Описание:
Фосфорамидит DMT-2′-O-TBDMS-рЦ(ац)-6-¹³C,5-d — это меченое изотопами ¹³C и дейтерием (D) производное цитидина, используемое в синтезе олигонуклеотидов методом фосфорамидитного подхода. Соединение содержит защитные группы: DMT (диметокситритил) на 5′-гидроксиле, TBDMS (трет-бутилдиметилсилил) на 2′-гидроксиле, ацетамидную группу (ац) на экзоциклическом амине цитозина и фосфорамидитную группу с 2-цианоэтильным защитным остатком. Продукт имеет высокую степень изотопной чистоты: ≥98 ат.% ¹³C и ≥98 ат.% D, химическая чистота ≥95% (определена ВЭЖХ). Применяется для получения меченых олигонуклеотидов в исследованиях по ядерному магнитному резонансу (ЯМР), масс-спектрометрии и изучению механизмов биохимических реакций.
Применение:
Данный фосфорамидит широко используется в синтезе РНК для введения стабильных изотопных меток (¹³C и D) в цитидиновые остатки. Основные направления применения: 1) Исследования структуры и динамики РНК методом ЯМР — мечение облегчает анализ спектров за счёт разрешения сигналов. 2) Кинетические исследования ферментативных реакций (например, рибозимов) с использованием масс-спектрометрии. 3) Изучение механизмов взаимодействия РНК-лиганд методом изотопного разбавления. 4) Создание меченых зондов для диагностических систем. Продукт поставляется НПО ЭкоТек в стопроцентно защищённой форме, готовой к использованию в автоматических синтезаторах олигонуклеотидов. При работе рекомендуется использовать безводные растворители и инертные условия.